Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms