Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb1P12658 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Calb1P12658 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb1P12658 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb1P12658 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb1P12658 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb1P12658 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms