Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtcP11725 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtcP11725 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtcP11725 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtcP11725 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtcP11725 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtcP11725 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
OtcP11725 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtcP11725 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 786.4 ms