Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lire1P11260 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Cd8a-202ENSMUST00000172321 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lire1P11260 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lire1P11260 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lire1P11260 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lire1P11260 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lire1P11260 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms