Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04213 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P04213 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P04213 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P04213 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P04213 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04213 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04213 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P04213 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04213 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P04213 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04213 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P04213 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04213 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04213 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04213 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04213 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04213 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04213 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04213 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04213 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P04213 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P04213 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P04213 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P04213 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P04213 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P04213 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P04213 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04213 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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