Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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H2-Ab1P01921 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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H2-Ab1P01921 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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H2-Ab1P01921 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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H2-Ab1P01921 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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H2-Ab1P01921 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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H2-Ab1P01921 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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H2-Ab1P01921 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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