Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ccl20O89093 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ccl20O89093 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ccl20O89093 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ccl20O89093 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ccl20O89093 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ccl20O89093 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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