Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BlmO88700 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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