Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp4O70480 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms