Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E2f6O54917 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms