Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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Opn1mwO35599 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Opn1mwO35599 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Opn1mwO35599 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Opn1mwO35599 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Opn1mwO35599 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Opn1mwO35599 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Opn1mwO35599 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Opn1mwO35599 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Opn1mwO35599 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Opn1mwO35599 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Opn1mwO35599 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Opn1mwO35599 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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