Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms