Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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Prrt1O35449 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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Prrt1O35449 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Prrt1O35449 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Prrt1O35449 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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