Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcns1O35173 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
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