Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Efna3O08545 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Efna3O08545 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms