Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC117090L7N257 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms