Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Gm8888J3QPX5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Gm8888J3QPX5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Gm8888J3QPX5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8888J3QPX5 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms