Protein–RNA interactions for Protein: J3QME2

Gm20914, Predicted gene, 20914, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20914J3QME2 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20914J3QME2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20914J3QME2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms