Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI0

Gm20815, Predicted gene, 20815, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20815J3KMI0 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20815J3KMI0 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20815J3KMI0 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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