Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm29394H3BIW7 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm29394H3BIW7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms