Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms