Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms