Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms