Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms