Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms