Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ssxb8B1AY40 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms