Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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