Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms