Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms