Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms