Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms