Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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Rnf4Q9QZS2 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Rnf4Q9QZS2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Rnf4Q9QZS2 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Rnf4Q9QZS2 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Rnf4Q9QZS2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Rnf4Q9QZS2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Rnf4Q9QZS2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Rnf4Q9QZS2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Rnf4Q9QZS2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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