Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms