Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Ercc4Q9QZD4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Ercc4Q9QZD4 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Ercc4Q9QZD4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ercc4Q9QZD4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ercc4Q9QZD4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ercc4Q9QZD4 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ercc4Q9QZD4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ercc4Q9QZD4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ercc4Q9QZD4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ercc4Q9QZD4 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ercc4Q9QZD4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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