Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Nr2e3Q9QXZ7 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Nr2e3Q9QXZ7 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Nr2e3Q9QXZ7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Nr2e3Q9QXZ7 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Nr2e3Q9QXZ7 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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