Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms