Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Gde1Q9JL56 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Gde1Q9JL56 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Gde1Q9JL56 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Gde1Q9JL56 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Gde1Q9JL56 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Gde1Q9JL56 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms