Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Hmgn5Q9JL35 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Hmgn5Q9JL35 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Hmgn5Q9JL35 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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Hmgn5Q9JL35 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Hmgn5Q9JL35 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Hmgn5Q9JL35 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Hmgn5Q9JL35 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Hmgn5Q9JL35 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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