Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms