Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ap3m1Q9JKC8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms