Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gpa33Q9JKA5 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms