Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX2

Sp6, Transcription factor Sp6, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp6Q9ESX2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Sp6Q9ESX2 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Sp6Q9ESX2 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Sp6Q9ESX2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Sp6Q9ESX2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Sp6Q9ESX2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Sp6Q9ESX2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Sp6Q9ESX2 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Sp6Q9ESX2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Sp6Q9ESX2 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Sp6Q9ESX2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Sp6Q9ESX2 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Sp6Q9ESX2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Sp6Q9ESX2 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Sp6Q9ESX2 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp6Q9ESX2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms