Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ube3bQ9ES34 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ube3bQ9ES34 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ube3bQ9ES34 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ube3bQ9ES34 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ube3bQ9ES34 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ube3bQ9ES34 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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