Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms