Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms