Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms