Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms