Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Cldn22Q9D7U6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
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Cldn22Q9D7U6 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
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Cldn22Q9D7U6 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Cldn22Q9D7U6 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Cldn22Q9D7U6 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Cldn22Q9D7U6 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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