Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Rep15Q9D7T1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Rep15Q9D7T1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Rep15Q9D7T1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Rep15Q9D7T1 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Rep15Q9D7T1 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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Rep15Q9D7T1 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Rep15Q9D7T1 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Rep15Q9D7T1 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Rep15Q9D7T1 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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