Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PrameQ9D4Z5 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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